染色质免疫沉淀（ChIP）
ChIP 染色质免疫沉淀服务，研究转录因子/组蛋白修饰与 DNA 的体内结合。
染色质免疫沉淀（ChIP）
染色质免疫沉淀（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）是研究体内蛋白质-DNA 相互作用（尤其是转录因子、组蛋白修饰与靶基因启动子/增强子区域结合）的核心表观遗传学技术。其原理为：甲醛交联固定细胞内蛋白-DNA 复合物 → 超声或酶切将染色质碎裂为 200-1000 bp 片段 → 特异性抗体免疫沉淀富集目标蛋白结合的 DNA 片段 → 解交联、纯化 DNA → 通过 qPCR（ChIP-qPCR）或高通量测序（ChIP-seq）分析结合位点。
维而勤提供从细胞培养、甲醛交联、染色质碎裂、免疫沉淀、解交联纯化到 qPCR / 测序文库构建与分析的全流程 ChIP 服务，可验证转录因子（如 HIF1A、NF-κB、STAT3 等）与组蛋白修饰（如 H3K4me3、H3K27ac）在特定基因组区域的富集，配套阳性对照（如 RNA Pol II / H3K4me3）与阴性对照（IgG），结果可靠可发表。
订购信息
支持 ChIP-qPCR（验证已知位点）与 ChIP-seq（全基因组筛选）两种方案，含交联 ChIP（X-ChIP）与自然 ChIP（N-ChIP，组蛋白修饰）。
| 目录号 | 服务项目 | 分析方式 | 适用靶标 | 交付时间 |
|---|---|---|---|---|
| CX1201 | ChIP-qPCR（单靶标单抗体） | qPCR 定量 | 转录因子 / 组蛋白修饰 | 15-20 个工作日 |
| CX1202 | ChIP-qPCR（多靶标 / 多抗体） | qPCR 定量 | 转录因子 / 组蛋白修饰 | 20-25 个工作日 |
| CX1203 | ChIP-seq（含文库构建） | 高通量测序 | 全基因组结合位点筛选 | 咨询 |
| CX1204 | ChIP 染色质碎裂条件优化（预实验） | 片段化验证 | 超声条件摸索 | 5-7 个工作日 |
| CX1205 | ChIP 全流程（交联 + IP + qPCR + 测序）套餐 | qPCR + 测序 | 深度验证 | 咨询 |
价格根据抗体提供方、靶标数与分析方式询价立即询价 →
实验方案对比
ChIP-qPCR
验证已知结合位点，定量精确
- 针对已知启动子/增强子区域设计引物，qPCR 定量富集程度
- 适合验证特定转录因子（如 HIF1A）与已知靶基因的结合
- 周期短、成本低，结果以 Input % 或富集倍数表示
ChIP-seq
全基因组筛选结合位点
- 免疫沉淀 DNA 构建测序文库，全基因组范围内定位结合峰（Peak）
- 适合发现未知靶基因与调控元件，揭示转录调控网络
- 配套峰调用、注释与motif 分析
X-ChIP（交联型，默认）
甲醛交联，适用转录因子
- 1% 甲醛交联固定蛋白-DNA，捕获瞬态结合
- 适用于转录因子与松散结合的调控蛋白
- 需超声碎裂染色质至 200-500 bp
N-ChIP（自然型）
无交联，适用组蛋白修饰
- 不甲醛交联，酶切（MNase）直接释放核小体
- 适用于稳定结合的组蛋白修饰（如 H3K4me3、H3K27me3）
- 抗原表位暴露充分，富集效率高
交付内容
交付染色质碎裂验证、富集 qPCR 数据 / 测序数据与全套对照，确保结果可追溯、可发表。
| 交付项目 | 内容说明 |
|---|---|
| 染色质碎裂验证 | 超声 / MNase 处理后 DNA 琼脂糖凝胶电泳图，确认片段 200-500 bp（X-ChIP）或单核小体（N-ChIP） |
| qPCR 富集数据 | Input %、富集倍数（Fold Enrichment）或占 Input 比例，含阳性对照（RNA Pol II / H3K4me3）与阴性对照（IgG） |
| 测序数据（ChIP-seq） | 原始 fastq、比对 BAM、峰调用（Peak calling）BED 文件、峰注释与 motif 分析 |
| 对照体系 | 阳性对照抗体、阴性对照 IgG 与 Input（1%-10%）对照完整数据 |
| 实验报告 | PDF 报告（含交联条件、超声参数、抗体信息、引物序列与结论） |
以上为参考交付范围，具体交付内容以双方确认的实验方案为准，详情请咨询技术支持。
质控标准
ChIP 全流程质控确保富集特异、可重复：
✓交联固定
方法：1% 甲醛室温交联 8-10 min，2.5 M 甘氨酸（终浓度 125 mM）终止 5 min
标准：交联充分不过度，蛋白-DNA 复合物稳定
✓染色质碎裂
方法：超声（X-ChIP）或 MNase 酶切（N-ChIP），琼脂糖凝胶验证
标准：X-ChIP 片段 200-500 bp，N-ChIP 单核小体（~150 bp）
✓免疫沉淀
方法：Protein A/G 磁珠（默认）或琼脂糖珠 + 特异性抗体
标准：阳性对照富集显著，IgG 阴性对照富集低
✓富集效率
方法：qPCR 检测已知位点（Input % 法）
标准：阳性对照位点 Input % ≥ 1%，IgG 对照 < 0.1%
✓测序质控（ChIP-seq）
方法：文库浓度、片段大小、测序数据量（≥ 20 M reads/样）
标准：峰调用可靠，FRiP（reads in peaks）≥ 1%
技术参数
关键参数
200-500 bp（X-ChIP 碎裂片段）
X-ChIP 经超声碎裂至 200-500 bp（多数靶标推荐 200-300 bp，ChIP-seq 需更窄分布）；N-ChIP 经 MNase 酶切至单核小体约 150 bp。碎裂均一性是 ChIP 成功的关键，需针对细胞类型优化超声功率与次数。
⚠️以下情形可能影响结果
- •低丰度或弱结合转录因子（如某些核受体）富集信号弱，可能需增加起始细胞量（≥ 1×10⁷）
- •甲醛敏感性蛋白（某些转录因子）交联后表位被遮蔽，建议改用双交联（DSP + 甲醛）或 N-ChIP
- •客户提供的抗体未经 ChIP 级验证，可能富集效率低
- •客户提供的细胞样品活性差或固定不及时，影响交联质量
客户提供
委托维而勤前请按以下清单准备材料：
- ✓提供靶标蛋白信息：蛋白名称、基因 ID、物种来源与预期结合位点（如已知）
- ✓提供或委托代购 ChIP 级特异性抗体（注明货号、物种反应性、ChIP 应用验证）
- ✓提供对数生长期细胞（≥ 1×10⁷ / 样）或委托维而勤培养，注明培养条件
- ✓ChIP-qPCR 请提供或委托设计检测位点引物（含阳性位点与阴性位点）
- ✓明确分析方式（ChIP-qPCR / ChIP-seq）与对照设置需求
- ✓提供文献参考或预期结果（如有），便于方案确认
抗体的 ChIP 级验证是实验成功的关键，建议选用经 ChIP 应用验证的抗体（如 CST、Abcam、Diagenode 等品牌）；客户自备非 ChIP 级抗体的项目，富集效率可能不达标，建议先做抗体预实验评估。
交付周期
标准交付周期
15-25 个工作日
从确认方案与收到合格细胞/抗体次日起算；ChIP-qPCR 单靶标 15-20 个工作日，多靶标 20-25 个工作日；ChIP-seq 含文库构建与测序分析约 30-40 个工作日；需超声条件优化或抗体预实验的项目相应延长，以合同为准。
本页内容为一般性介绍，实际交付物、规格与周期以双方确认的实验方案及合同为准，详情请咨询技术支持。